PDB文件头中时间格式解析

拼搏现实的明天。 2022-09-25 12:25 112阅读 0赞

在做生物信息学时，经常需要使用到Protein Data Bank中的数据，时不时的需要使用PDB文件中的时间（时间格式为10-MAR-14 (2014年三月10日)）将已有数据分成训练数据和独立测试数据，时间如何解析是一件比较简单的事情，为了方便寻找故将这段代码贴在这里。

<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif; background-color: rgb(255, 255, 255);">
    </span>

private static double parsePDBTimeStr(String pdb_time){ // eg.: 10-MAR-14 
    		System.out.println(pdb_time);
    		
    		double year = Double.parseDouble(pdb_time.substring(7, 9)); 
    		if (year > 16){ //将年份换算成4位数
    			year += 1900;
    		}else{
    			year += 2000;
    		}
    		String month = pdb_time.substring(3, 6);
    		double mon = 0;
    		if (month.equals("JAN")){
    			mon = 1;
    		}else if (month.equals("FEB")){
    			mon = 2;
    		}else if (month.equals("MAR")){
    			mon = 3;
    		}else if (month.equals("APR")){
    			mon = 4;
    		}else if (month.equals("MAY")){
    			mon = 5;
    		}else if (month.equals("JUN")){
    			mon = 6;
    		}else if (month.equals("JUL")){
    			mon = 7;
    		}else if (month.equals("AUG")){
    			mon = 8;
    		}else if (month.equals("SEP")){
    			mon = 9;
    		}else if (month.equals("OCT")){
    			mon = 10;
    		}else if (month.equals("NOV")){
    			mon = 11;
    		}else if (month.equals("DEC")){
    			mon = 12;
    		}
    		double day = Double.parseDouble(pdb_time.substring(0, 2)); 
    		return year*10000+mon*100+day;
    	}

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