openmp超线程并行比串行慢_并行计算笔记(001)

深藏阁楼爱情的钟 2023-01-10 13:24 105阅读 0赞

**并行计算笔记(001)-安装mpi,openmp** **动力**  
需要用高性能计算求解微分方程，这也将是我这接下来三年的学习方向之一。目前以MPI为主，将来肯定会涉及到异构计算。希望写这些笔记记录我的修炼历程。目前的学习目标及就是掌握将偏微分方程组的差分形式稠密化。 **对将来的看法**  
主要的方向是并行计算的程序开发。希望能够做数学性更强的研究。并行计算最合适的看来还是神经网络和计算机图形学。因为如果要将计算潜力发挥出来，需要时间复杂度和空间复杂度是一个量级的。偏微分方程组的差分求解的问题在于，将偏微分方程组差分化之后，得到的是稀疏矩阵，无法完全发挥计算潜力。  
所以将来可能会涉及一些计算机图形学和神经网络，主要还是应用，计算机体系结构会涉及的比较少。 **为并行机编程\[1\]**  
1988年McGraw和Axelrod定义了为并行机开发应用软件的四条不同的途径。  
1. 扩展现有编译器以便将串行程序转化为并行程序。  
2. 扩展现有编程语言，增加新操作以允许用户表达并行性。  
3. 在现有串行语言上增加一个并行语言层。  
4. 定义全新的并行语言和编译系统。

现状:最流行的是在现有的串行语言上，通过增加用函数调用或编译指导语句来表示低层语句，使用MPI,OpenMP就是这方面的例子。低层并行编程可以产生具有高性能和好的移植性的并行程序。与高层并行编程语言相比，其不足之处在于编程和调试比较难。 **windows下利用Mingw和msmpi编译运行mpi并行程序\[2\]\[3\]** **1. 安装Mingw和msmpi** **1.1 mingw-w64**  
参考这个 https://blog.csdn.net/ZHAOJUNWEI08/article/details/86602120  
下载一套mingw不用安装,直接解压到某个位置，把mingw下的bin目录加入环境变量。  
输入gcc -v  
得到gcc version 8.1.0 (x86\_64-posix-seh-rev0, Built by MinGW-W64 project)，说明安装好了。 **1.2 msmpi**  
\[msmpi\](https://docs.microsoft.com/en-us/message-passing-interface/microsoft-mpi)是微软提供的mpi实现。下载好两个文件msmpisdk.msi and MSMpiSetup.exe都装好。  
在cmd中输入set MSMPI,得到  
MSMPI\_BENCHMARKS=C:Program FilesMicrosoft MPIBenchmarks  
MSMPI\_BIN=C:Program FilesMicrosoft MPIBin  
MSMPI\_INC=C:Program Files (x86)Microsoft SDKsMPIInclude  
MSMPI\_LIB32=C:Program Files (x86)Microsoft SDKsMPILibx86  
MSMPI\_LIB64=C:Program Files (x86)Microsoft SDKsMPILibx64

64位系统得到这样的结果表示安装好了msmpi。  
按照\[MinGW coding under Windows (C, C++, OpenMP, MPI)\](https://www.math.ucla.edu/~wotaoyin/windows\_coding.html)  
处理一下msmpi文件,其中$MSMPI\_LIB64这些路径由set MSMPI查看。

> mkdir ~/msmpi \# create a temporary folder under your home directory  
> cd ~/msmpi \# enter the folder  
> cp "$MSMPI\_LIB64/msmpi.lib" . \# copy msmpi.lib to ~/msmpi/; the import library, which is a placeholder for dll  
> cp "$WINDIR/system32/msmpi.dll" . \# copy msmpi.dll to ~/msmpi/; the runtime library  
> gendef msmpi.dll \# generate msmpi.def. For 32-bit, use: gendef -a msmpi.dll, which specifies the stdcall format  
> dlltool -d msmpi.def -D msmpi.dll -l libmsmpi.a \# generate the (static) library file libmsmpi.a  
> cp libmsmpi.a /mingw64/lib \# copy this library file to where g++ looks for them;  
\# try "g++ --print-search-dirs"  
> cp "$MSMPI\_INC/mpi.h" . \# copy the header file mpi.h to ~/msmpi/

在 ~/msmpi 文件夹中,打开 mpi.h文件 , 找到“typedef \_\_int64 MPI\_Aint”，在这条语句上面一行加上 “\#include <stdint.h>” (without the quotes), 来定义 \_\_int64.  
> cp mpi.h /mingw64/include \# copy the header file to the default include folder  
c程序的编译命令和运行命令为：

>gcc -o mpi\_hello\_world.exe mpi\_hello\_world.c -l msmpi -L "C:Program Files (x86)Microsoft SDKsMPILibx64" -I "C:Program Files (x86)Microsoft SDKsMPIInclude"

运行程序命令为mpiexec -n 3 mpi\_hello\_world.exe,这里3是进程数  
得到

Hello world from processor LAPTOP-8JDFVNA8, rank 2 out of 3 processors  
Hello world from processor LAPTOP-8JDFVNA8, rank 0 out of 3 processors  
Hello world from processor LAPTOP-8JDFVNA8, rank 1 out of 3 processors

**1.3 openmp**  
编译使用openmp需要加上 -fopenmp  
gcc -fopenmp omp\_hello.c -o omp\_hello

**总结**

win10环境下使用msmpi其实有点麻烦，linux使用openmpi其实非常简单。关于msmpi,下面是今天安装测试用到的所有文件。

https://github.com/chenlin0/Learning/tree/master/MPI

其实visual studio配置msmpi看起来更好用，不过因为以后主要还是使用linux，所以还是使用gcc

**参考文献**

\[1\] Parallel Programming in C with MPI and OpenMP, Michael J. Quinn, McGraw-Hill, 2003.

\[2\] https://blog.csdn.net/xenonhu/article/details/78196443

\[3\] https://www.math.ucla.edu/~wotaoyin/windows\_coding.html