毕业了——课题代码开源（一）使用Palabos包将其他数据转为vti

朱雀 2023-02-16 09:24 3阅读 0赞

# 简介 #

因为我的课题涉及多孔介质结构的相关几何分析，比如空隙分析，迂曲度分析等，因为不想直接自己写vti输出，而且Palabos中又有已经现成可以使用的输出函数可以调用，所以直接写了一个转换程序，将我自己的数据，转成Paraview可以读取的vti数据。

# 代码 #

#include "palabos3D.h"
    #include "palabos3D.hh"
    
    #include <vector>
    #include <cmath>
    #include <cstdlib>
    
    using namespace plb;
    
    typedef double T;
    
    void readGeometry(std::string fNameIn, std::string fNameOut, MultiScalarField3D<float>& geometry, std::string valueTag)
    {
        
        const plint nx = geometry.getNx();
        const plint ny = geometry.getNy();
        const plint nz = geometry.getNz();
    
        Box3D sliceBox(0,0, 0,ny-1, 0,nz-1);
        std::auto_ptr<MultiScalarField3D<float> > slice = generateMultiScalarField<float>(geometry, sliceBox);
        plb_ifstream geometryFile(fNameIn.c_str());
        for (plint iX=0; iX<nx; ++iX) {
        
            if (!geometryFile.is_open()) {
        
                pcout << "Error: could not open geometry file " << fNameIn << std::endl;
                exit(EXIT_FAILURE);
            }
            geometryFile >> *slice;
            copy(*slice, slice->getBoundingBox(), geometry, Box3D(iX,iX, 0,ny-1, 0,nz-1));
        }
    
        {
        
            VtkImageOutput3D<T> vtkOut(valueTag, 1.0);
            vtkOut.writeData<float>(*copyConvert<float,T>(geometry, geometry.getBoundingBox()), valueTag, 1.0);
        }
    
    }
    
    int main(int argc, char **argv)
    {
        
        plbInit(&argc, &argv);
    
        if (argc!=7) {
        
            pcout << "Error missing some input parameter\n";
            pcout << "The structure is :\n";
            pcout << "1. Input file name.\n";
            pcout << "2. Output directory name.\n";
            pcout << "3. number of cells in X direction.\n";
            pcout << "4. number of cells in Y direction.\n";
            pcout << "5. number of cells in Z direction.\n";
            pcout << "6. value tag\n";
            pcout << "Example: " << argv[0] << " palabos.dat tmp/ 201 201 201 abc\n";
            exit (EXIT_FAILURE);
        }
        std::string fNameIn  = argv[1];
        std::string fNameOut = argv[2];
    
        const plint nx = atoi(argv[3]);
        const plint ny = atoi(argv[4]);
        const plint nz = atoi(argv[5]);
    
        std::string valueTag = argv[6];
    
        global::directories().setOutputDir(fNameOut+"/");
    
        pcout << "Reading the geometry file." << std::endl;
        MultiScalarField3D<float> geometry(nx,ny,nz);
        readGeometry(fNameIn, fNameOut, geometry, valueTag);
    
        return 0;
    }

# 说明 #

这个代码起源自原始案例中的渗透，即[Palabos案例解析（一）permeability.cpp案例][Palabos_permeability.cpp]  
我只是进行了一些简化，只使用其中的数据读入以及输出的内容，在原始案例中，读入的几何结构只能读整数，在这个代码中，可以读取任何浮点数，并输出为vti格式，使用paraview进行处理。  
使用方法与渗透案例相同。  
无图无真相，这两个图是我计算迂曲度时所获得的路径，写成对应于palabos的输入格式，就可以简便的转成vti格式而不用自己写vti数据头。  
![在这里插入图片描述][20200609150431275.png]![在这里插入图片描述][20200609150450890.png]

# 完 #

[Palabos_permeability.cpp]: https://blog.csdn.net/qq_28632981/article/details/103756787
[20200609150431275.png]: https://img-blog.csdnimg.cn/20200609150431275.png
[20200609150450890.png]: https://img-blog.csdnimg.cn/20200609150450890.png