用R语言绘制优美的生存曲线

短命女 2024-03-23 21:38 170阅读 0赞

用R语言绘制优美的生存曲线

生存曲线是生物学和医学研究中常用的可视化工具，用于描述个体或群体在一段时间内存活的概率。在R语言中，我们可以使用一些库来绘制漂亮的生存曲线，例如survival和ggplot2。

首先，我们需要加载所需的库并准备数据。假设我们有一个包含个体生存时间和事件状态（是否发生事件）的数据集。以下是一个示例数据集，包含了10个个体的生存时间和事件状态：

  1. # 加载所需的库
  2. library(survival)
  3. library(ggplot2)
  5. # 创建一个示例数据集
  6. time <- c(12, 15, 18, 24, 30, 36, 42, 48, 54, 60)
  7. status <- c(1, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 1)
  9. # 创建生存时间和事件状态的数据框
  10. data <- data.frame(time, status)

接下来，我们可以使用survfit()函数计算生存曲线的估计值。该函数可以接受一个生存对象作为参数，我们可以使用Surv()函数创建一个生存对象。

  1. # 计算生存曲线的估计值
  2. surv_fit <- survfit(Surv(time, status) ~ 1, data = data)

现在，我们可以使用ggsurvplot()函数来绘制生存曲线。这个函数使用ggplot2库来创建一个美观的图形，并根据生存曲线的不同组进行着色。

  1. # 绘制生存曲线
  2. ggsurvplot(surv_fit, data =

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